Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHACTR1Q9C0D0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms