Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RBM42Q9BTD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBM42Q9BTD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms