Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPRD1AQ96P16 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPRD1AQ96P16 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms