Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TOPBP1Q92547 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC38■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
TOPBP1Q92547 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOPBP1Q92547 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOPBP1Q92547 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms