Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE82

SH3TC1, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC1Q8TE82 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH3TC1Q8TE82 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3TC1Q8TE82 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms