Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFCAB12Q6NXP0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFCAB12Q6NXP0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms