Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEDD8Q15843 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEDD8Q15843 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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