Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSHL1Q14406 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms