Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTAN1Q13813 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SPTAN1Q13813 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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