Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SHROOM2Q13796 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHROOM2Q13796 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHROOM2Q13796 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms