Protein–RNA interactions for Protein: Q04726

TLE3, Transducin-like enhancer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE3Q04726 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE3Q04726 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE3Q04726 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms