Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5Q00535 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDK5Q00535 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDK5Q00535 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms