Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GNB1P62873 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GNB1P62873 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GNB1P62873 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GNB1P62873 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GNB1P62873 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GNB1P62873 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GNB1P62873 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms