Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DMDP11532 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DMDP11532 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DMDP11532 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DMDP11532 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DMDP11532 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DMDP11532 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DMDP11532 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DMDP11532 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DMDP11532 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DMDP11532 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DMDP11532 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DMDP11532 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DMDP11532 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DMDP11532 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DMDP11532 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DMDP11532 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DMDP11532 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DMDP11532 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DMDP11532 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DMDP11532 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DMDP11532 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DMDP11532 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DMDP11532 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DMDP11532 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DMDP11532 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DMDP11532 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DMDP11532 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
DMDP11532 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DMDP11532 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DMDP11532 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DMDP11532 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DMDP11532 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DMDP11532 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DMDP11532 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DMDP11532 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DMDP11532 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms