Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOCP08134 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOCP08134 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOCP08134 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOCP08134 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOCP08134 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOCP08134 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOCP08134 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOCP08134 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOCP08134 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOCP08134 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms