Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBXN7O94888 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBXN7O94888 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms