Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01549A6NIU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01549A6NIU2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms