Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHAC2Q9Y5I4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms