Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UTP11Q9Y3A2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTP11Q9Y3A2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTP11Q9Y3A2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms