Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRPC6Q9Y210 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRPC6Q9Y210 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms