Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASS4Q9NQ75 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASS4Q9NQ75 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms