Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHACTR1Q9C0D0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR1Q9C0D0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR1Q9C0D0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms