Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-6Q9BXR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVK-6Q9BXR3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms