Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFHD1Q9BUP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFHD1Q9BUP0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFHD1Q9BUP0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms