Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
SIRT1Q96EB6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SIRT1Q96EB6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIRT1Q96EB6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms