Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Q3C1V9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Q3C1V9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Q3C1V9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Q3C1V9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Q3C1V9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Q3C1V9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Q3C1V9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Q3C1V9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Q3C1V9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Q3C1V9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms