Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRT24Q2M2I5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT24Q2M2I5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT24Q2M2I5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms