Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DUOXA1Q1HG43 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms