Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNX3Q13761 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RUNX3Q13761 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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