Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCE1P61221 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms