Protein–RNA interactions for Protein: P46092

CCR10, C-C chemokine receptor type 10, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR10P46092 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR10P46092 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR10P46092 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR10P46092 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR10P46092 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR10P46092 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR10P46092 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR10P46092 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR10P46092 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR10P46092 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR10P46092 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR10P46092 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR10P46092 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR10P46092 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms