Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC5P28715 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC5P28715 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms