Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APODP05090 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APODP05090 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APODP05090 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APODP05090 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APODP05090 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APODP05090 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APODP05090 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APODP05090 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APODP05090 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APODP05090 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APODP05090 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APODP05090 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APODP05090 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APODP05090 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APODP05090 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APODP05090 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms