Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
N4BP3O15049 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4BP3O15049 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms