Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGEF2Q9Y6D5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms