Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNFRSF19Q9NS68 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms