Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC3Q9BY71 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC3Q9BY71 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.4 ms