Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MIPEPQ99797 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MIPEPQ99797 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MIPEPQ99797 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms