Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRIPQ8WXE1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATRIPQ8WXE1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRIPQ8WXE1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms