Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP30Q70CQ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP30Q70CQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms