Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CASC2Q6XLA1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CASC2Q6XLA1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms