Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDHAF4Q5VUM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDHAF4Q5VUM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms