Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC45A4Q5BKX6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC45A4Q5BKX6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms