Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIF1AQ16665 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIF1AQ16665 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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