Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNCBQ16143 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNCBQ16143 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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