Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SPTAN1Q13813 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTAN1Q13813 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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