Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIPK1Q13546 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIPK1Q13546 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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