Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPP2Q13103 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPP2Q13103 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms