Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MBP1YDL056W 2502 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 NOC4YPR144C 1659 nt4.7□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPK3YBR028C 1578 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 TYW3YGL050W 822 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 SEC28YIL076W 891 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 NTR2YKR022C 969 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YLR346CYLR346C 306 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YOL166CYOL166C 339 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 COX11YPL132W 903 nt4.7□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 CDC28YBR160W 897 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 SKG3YLR187W 3081 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 MDM10YAL010C 1482 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 CIA2YHR122W 696 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YML090WYML090W 387 nt4.69□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPO20YMR017W 1194 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YNL226WYNL226W 411 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 CIN5YOR028C 888 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 OSW1YOR255W 837 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 RER1YCL001W 567 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PXA1YPL147W 2613 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 CBF5YLR175W 1452 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 ADE6YGR061C 4077 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YHR177WYHR177W 1362 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 KGD1YIL125W 3045 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PAL1YDR348C 1500 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 RCK2YLR248W 1833 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 AUA1YFL010W-A 285 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 TIM21YGR033C 720 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PCT1YGR202C 1275 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PPE1YHR075C 1203 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YHR112CYHR112C 1137 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 DAN1YJR150C 897 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 MRT4YKL009W 711 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YLR326WYLR326W 723 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 LTO1YNL260C 597 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 ECM23YPL021W 564 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 MAK3YPR051W 531 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 MET16YPR167C 786 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 EFM2YBR271W 1260 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 ASK10YGR097W 3441 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 SAP155YFR040W 3009 nt4.68□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATH1YPR026W 3636 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PSY4YBL046W 1326 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YJL206CYJL206C 2277 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 NOP58YOR310C 1536 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PRP43YGL120C 2304 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 ARN1YHL040C 1884 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 AIR1YIL079C 1083 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 TFA2YKR062W 987 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 SEC65YML105C 822 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YMR178WYMR178W 825 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 snR17bsnR17b 332 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 UBP9YER098W 2265 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 MUP3YHL036W 1641 nt4.67□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 VHS2YIL135C 1311 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 HPC2YBR215W 1878 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YMR111CYMR111C 1389 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 LUC7YDL087C 786 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 SHR3YDL212W 633 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YFR035CYFR035C 345 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 RPF2YKR081C 1035 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 PRM9YAR031W 897 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YLR225CYLR225C 1224 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YLR374CYLR374C 390 nt4.66□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 ROT1YMR200W 771 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 YHL012WYHL012W 1482 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 EMP46YLR080W 1335 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 TIP20YGL145W 2106 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 ALG6YOR002W 1635 nt4.65□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 GPR1YDL035C 2886 nt4.65□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 BLM10YFL007W 6432 nt4.65□□□□□ -1.66
PUF2Q12221 UBC1YDR177W 648 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 ACP1YKL192C 378 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 MAP2YBL091C 1266 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 KAR5YMR065W 1515 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 ALD3YMR169C 1521 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 ALD2YMR170C 1521 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 KRS1YDR037W 1776 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 GAS2YLR343W 1668 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 MSC7YHR039C 1935 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 SAP4YGL229C 2457 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YTA6YPL074W 2265 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YDR282CYDR282C 1245 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 SPR6YER115C 576 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 IRC6YFR043C 714 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YGR168CYGR168C 1131 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 RPS0BYLR048W 759 nt4.64□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 YAR023CYAR023C 540 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 RGS2YOR107W 930 nt4.64□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPN8YOR261C 1017 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 GRE1YPL223C 507 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 CUS1YMR240C 1311 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 EKI1YDR147W 1605 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 TGL1YKL140W 1647 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 GAD1YMR250W 1758 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 RRB1YMR131C 1536 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 PRP9YDL030W 1593 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF2Q12221 YDR124WYDR124W 975 nt4.63□□□□□ -1.67
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