RNA–Protein interactions for RNA: YHR177W

YHR177W, Transcript of Putative transcription factor containing a WOPR domain, yeastyeast

Gene YHR177W, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR177WYHR177W MTC1P47018 478 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
YHR177WYHR177W FAP1P53971 965 aa15.75■□□□□ 0.11
YHR177WYHR177W DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
YHR177WYHR177W PRY3P47033 881 aa14.84□□□□□ -0.03
YHR177WYHR177W PRI1P10363 409 aa14.47□□□□□ -0.09
YHR177WYHR177W AAD16Q02895 342 aa14.47□□□□□ -0.09
YHR177WYHR177W ISW2Q08773 1120 aa14□□□□□ -0.17
YHR177WYHR177W YCK3P39962 524 aa13.99□□□□□ -0.17
YHR177WYHR177W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
YHR177WYHR177W RPG1P38249 964 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
YHR177WYHR177W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
YHR177WYHR177W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
YHR177WYHR177W MRPL32P25348 183 aa13.11□□□□□ -0.31
YHR177WYHR177W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
YHR177WYHR177W YGL015CP33199 130 aa12.79□□□□□ -0.36
YHR177WYHR177W REB1P21538 810 aa12.69□□□□□ -0.38
YHR177WYHR177W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
YHR177WYHR177W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
YHR177WYHR177W AVT3P36062 692 aa12.67□□□□□ -0.38
YHR177WYHR177W CDC27P38042 758 aa12.3□□□□□ -0.44
YHR177WYHR177W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
YHR177WYHR177W SPT21P35209 758 aa12.11□□□□□ -0.47
YHR177WYHR177W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
YHR177WYHR177W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
YHR177WYHR177W MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
YHR177WYHR177W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
YHR177WYHR177W TFC8Q12308 588 aa11.89□□□□□ -0.51
YHR177WYHR177W HOP09932 586 aa11.86□□□□□ -0.51
YHR177WYHR177W DCD1P06773 312 aa11.8□□□□□ -0.52
YHR177WYHR177W SCY1P53009 804 aa11.65□□□□□ -0.55
YHR177WYHR177W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
YHR177WYHR177W TGL3P40308 642 aa11.57□□□□□ -0.56
YHR177WYHR177W RIM101P33400 625 aa11.56□□□□□ -0.56
YHR177WYHR177W SLX5P32828 619 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
YHR177WYHR177W BCH2P36122 765 aa11.47□□□□□ -0.57
YHR177WYHR177W UBP9P39967 754 aa11.42□□□□□ -0.58
YHR177WYHR177W SIS1P25294 352 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
YHR177WYHR177W OXP1P28273 1286 aa11.13□□□□□ -0.63
YHR177WYHR177W EPS1P40557 701 aa11.13□□□□□ -0.63
YHR177WYHR177W BDF1P35817 686 aa11.11□□□□□ -0.63
YHR177WYHR177W MST1P07236 462 aa11.02□□□□□ -0.65
YHR177WYHR177W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
YHR177WYHR177W PTP3P40048 928 aa10.97□□□□□ -0.65
YHR177WYHR177W YOR238WQ08634 303 aa10.93□□□□□ -0.66
YHR177WYHR177W YBL029C-AQ3E756 94 aa10.89□□□□□ -0.67
YHR177WYHR177W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.87□□□□□ -0.67not detected
YHR177WYHR177W BBC1P47068 1157 aa10.83□□□□□ -0.68
YHR177WYHR177W RSM7P47150 247 aa10.82□□□□□ -0.68
YHR177WYHR177W VNX1P42839 908 aa10.77□□□□□ -0.68
YHR177WYHR177W AI2P03876 854 aa10.77□□□□□ -0.69
YHR177WYHR177W YAP5P40574 245 aa10.76□□□□□ -0.69
YHR177WYHR177W SPP1Q03012 353 aa10.67□□□□□ -0.7
YHR177WYHR177W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YHR177WYHR177W WSC3Q12215 556 aa10.62□□□□□ -0.71
YHR177WYHR177W TIF11P38912 153 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
YHR177WYHR177W GTT3P39996 337 aa10.52□□□□□ -0.73
YHR177WYHR177W YLR271WQ06152 274 aa10.51□□□□□ -0.73
YHR177WYHR177W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
YHR177WYHR177W TFA1P36100 482 aa10.49□□□□□ -0.73
YHR177WYHR177W FKH1P40466 484 aa10.47□□□□□ -0.73
YHR177WYHR177W YJL171CP46992 396 aa10.45□□□□□ -0.74
YHR177WYHR177W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
YHR177WYHR177W ULI1P43604 169 aa10.37□□□□□ -0.75
YHR177WYHR177W LDB19Q12502 818 aa10.37□□□□□ -0.75
YHR177WYHR177W PIB1Q06651 286 aa10.36□□□□□ -0.75
YHR177WYHR177W IOC2Q12072 812 aa10.36□□□□□ -0.75
YHR177WYHR177W MRM1P25270 412 aa10.33□□□□□ -0.76
YHR177WYHR177W MSB4Q12317 492 aa10.28□□□□□ -0.76
YHR177WYHR177W BMT6Q12291 365 aa10.26□□□□□ -0.77
YHR177WYHR177W EAP1P36041 632 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
YHR177WYHR177W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.23□□□□□ -0.77not detected
YHR177WYHR177W SSP1P38871 571 aa10.2□□□□□ -0.78
YHR177WYHR177W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data10.17□□□□□ -0.78not detected
YHR177WYHR177W YOL036WQ08206 761 aa10.16□□□□□ -0.78
YHR177WYHR177W VPS29P38759 282 aa10.14□□□□□ -0.79
YHR177WYHR177W SET4P42948 560 aa10.14□□□□□ -0.79
YHR177WYHR177W TRP5P00931 707 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
YHR177WYHR177W DBP1P24784 617 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
YHR177WYHR177W RTG1P32607 177 aa10.13□□□□□ -0.79
YHR177WYHR177W NCR1Q12200 1170 aa10.11□□□□□ -0.79
YHR177WYHR177W RTG3P38165 486 aa10.09□□□□□ -0.79
YHR177WYHR177W CST9Q06032 482 aa10.08□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W YFR006WP43590 535 aa10.06□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W SEC61P32915 480 aa10.05□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W MGA2P40578 1113 aa10.05□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W SAM3Q08986 587 aa10.05□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W STS1P38637 319 aa10.03□□□□□ -0.8
YHR177WYHR177W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
YHR177WYHR177W RCR1P38212 213 aa9.9□□□□□ -0.82
YHR177WYHR177W DAN4P47179 1161 aa9.9□□□□□ -0.82
YHR177WYHR177W ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
YHR177WYHR177W JIP4Q03361 876 aa9.89□□□□□ -0.83
YHR177WYHR177W GYP5Q12344 894 aa9.86□□□□□ -0.83
YHR177WYHR177W SAP30P38429 201 aa9.84□□□□□ -0.83
YHR177WYHR177W YDL129WQ07555 291 aa9.81□□□□□ -0.84
YHR177WYHR177W HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
YHR177WYHR177W HTA2P04912 132 aa9.8□□□□□ -0.84
YHR177WYHR177W PTC4P38089 393 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.9 ms